Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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ERCC8Q13216 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ERCC8Q13216 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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ERCC8Q13216 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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ERCC8Q13216 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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ERCC8Q13216 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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ERCC8Q13216 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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ERCC8Q13216 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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ERCC8Q13216 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERCC8Q13216 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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