Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DUSP4Q13115 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DUSP4Q13115 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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