Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
MKRN3Q13064 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
MKRN3Q13064 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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