Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
HSPB3Q12988 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
HSPB3Q12988 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms