Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
GRIN2AQ12879 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
GRIN2AQ12879 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms