Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CHD3Q12873 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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