Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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RABGGTBP53611 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGGTBP53611 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
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RABGGTBP53611 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTBP53611 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTBP53611 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGGTBP53611 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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