| GLI1 | P08151 | HMGN2P18-201 | ENST00000450680 | 270 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | UBE2DNL-203 | ENST00000474922 | 222 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNY4P20-201 | ENST00000516678 | 93 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC068339.1-201 | ENST00000526965 | 141 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC004486.1-201 | ENST00000546846 | 233 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | EIF4BP1-201 | ENST00000554881 | 351 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR6852-201 | ENST00000621699 | 66 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNY4P6-201 | ENST00000363667 | 96 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-414P-201 | ENST00000363705 | 104 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | SNORD56.5-201 | ENST00000364281 | 72 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | Y_RNA.253-201 | ENST00000364562 | 112 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR518F-201 | ENST00000384973 | 87 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RPS3AP1-201 | ENST00000413190 | 320 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | SNRPGP10-201 | ENST00000432323 | 225 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MTATP8P2-201 | ENST00000435212 | 202 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AL049873.1-201 | ENST00000480540 | 376 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | HMGN1P7-201 | ENST00000491722 | 313 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC010255.2-201 | ENST00000505209 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MRPS36P2-201 | ENST00000512569 | 299 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC021491.3-201 | ENST00000513378 | 156 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC074131.1-201 | ENST00000514662 | 253 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-826P-201 | ENST00000516827 | 104 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | IGKV3-31-201 | ENST00000523109 | 329 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC008507.4-201 | ENST00000585464 | 127 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC073413.2-201 | ENST00000604332 | 360 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | DLEU2_6.1-201 | ENST00000610536 | 112 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | HMHB1-202 | ENST00000638299 | 126 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | PRKG1-205 | ENST00000401604 | 5922 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | PIK3CA-201 | ENST00000263967 | 9093 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | TMEM232-201 | ENST00000455884 | 2501 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | LCORL-202 | ENST00000382224 | 4984 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | SYTL2-230 | ENST00000634661 | 6672 nt | TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | TAB2-201 | ENST00000367456 | 4553 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-486P-201 | ENST00000363116 | 107 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | SNORA80A-201 | ENST00000363922 | 136 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | Z96811.1-201 | ENST00000445880 | 108 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RPS26P48-201 | ENST00000491713 | 339 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNA5SP112-201 | ENST00000515937 | 99 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6ATAC17P-201 | ENST00000516074 | 71 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU2-34P-201 | ENST00000516534 | 121 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC141557.1-201 | ENST00000540982 | 400 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC079600.2-201 | ENST00000550076 | 130 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR3670-1-201 | ENST00000584160 | 65 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR3670-3-201 | ENST00000584855 | 65 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RPL12P50-201 | ENST00000603116 | 116 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | SNORD115-40-201 | ENST00000606510 | 82 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR3670-4-201 | ENST00000612260 | 65 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC023490.1-201 | ENST00000614584 | 375 nt | TSL 2 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MALAT1.1-201 | ENST00000618249 | 95 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | Y_RNA.818-201 | ENST00000618813 | 71 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC011718.1-201 | ENST00000622906 | 375 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | NOC3L-201 | ENST00000371361 | 3455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC009487.2-201 | ENST00000420969 | 6821 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MCF2-204 | ENST00000414978 | 3813 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | CEP57-213 | ENST00000541150 | 2911 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR494-201 | ENST00000349529 | 81 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU1-112P-201 | ENST00000364401 | 164 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR450A2-201 | ENST00000385022 | 100 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR520G-201 | ENST00000385064 | 90 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | TRAJ26-201 | ENST00000390511 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC233266.1-201 | ENST00000454518 | 96 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | CFLAR-AS1-202 | ENST00000474886 | 223 nt | TSL 3 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-586P-201 | ENST00000517265 | 104 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR5197-201 | ENST00000583721 | 112 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AL033523.1-201 | ENST00000605153 | 153 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AL357054.2-201 | ENST00000607644 | 423 nt | TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC242852.1-201 | ENST00000612151 | 96 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR7106-201 | ENST00000612419 | 65 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | AC244015.1-201 | ENST00000622301 | 99 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| GLI1 | P08151 | TSLP-202 | ENST00000379706 | 2411 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | Y_RNA.213-201 | ENST00000364178 | 111 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | Y_RNA.344-201 | ENST00000365381 | 112 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | DEFB119-202 | ENST00000376315 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | SNRPGP13-201 | ENST00000442212 | 177 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | AC131956.1-201 | ENST00000506420 | 258 nt | TSL 2 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-904P-201 | ENST00000516206 | 101 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | SCARNA17.1-201 | ENST00000516211 | 143 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | SCARNA17.2-201 | ENST00000516334 | 143 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-1291P-201 | ENST00000516591 | 104 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-158P-201 | ENST00000517104 | 100 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNA5SP490-201 | ENST00000517141 | 136 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | AC135178.3-204 | ENST00000585181 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | AC104984.5-201 | ENST00000586878 | 94 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | U2.20-201 | ENST00000613956 | 192 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | SCARNA17.4-201 | ENST00000614296 | 143 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | AC006386.2-201 | ENST00000624491 | 75 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | AC012005.1-201 | ENST00000624575 | 75 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | Y_RNA.78-201 | ENST00000362970 | 110 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-690P-201 | ENST00000365242 | 106 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-820P-201 | ENST00000384273 | 107 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-1152P-201 | ENST00000384576 | 107 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | TRAV41-201 | ENST00000390468 | 336 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | MIR1253-201 | ENST00000408273 | 105 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | RNU6-1186P-201 | ENST00000410429 | 97 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | AP001486.1-201 | ENST00000463339 | 476 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | Y_RNA.685-201 | ENST00000516532 | 108 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | snoMBII-202.2-201 | ENST00000517263 | 86 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | GTF3AP2-201 | ENST00000557014 | 266 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| GLI1 | P08151 | AC022217.4-201 | ENST00000604389 | 163 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |