Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
J3QW42 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
J3QW42 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
J3QW42 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
J3QW42 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
J3QW42 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
J3QW42 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
J3QW42 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
J3QW42 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
J3QW42 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
J3QW42 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms