Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
J3KRW8 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
J3KRW8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
J3KRW8 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
J3KRW8 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
J3KRW8 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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