Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERVV-1B6SEH8 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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