Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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