Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer1Q9Z2Y3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms