Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcniQ9Z2V9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms