Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ube2aQ9Z255 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ube2aQ9Z255 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ube2aQ9Z255 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2aQ9Z255 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2aQ9Z255 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms