Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms