Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn3Q9Z0G9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms