Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFGEF2Q9Y6D5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms