Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATF5Q9Y2D1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF5Q9Y2D1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms