Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms