Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gpc1Q9QZF2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc1Q9QZF2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gpc1Q9QZF2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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