Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms