Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms