Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lsm4Q9QXA5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms