Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3a1Q9QX15 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms