Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tuba8Q9JJZ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tuba8Q9JJZ2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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