Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim39Q9ESN2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim39Q9ESN2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim39Q9ESN2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim39Q9ESN2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim39Q9ESN2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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