Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cab39lQ9DB16 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cab39lQ9DB16 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cab39lQ9DB16 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms