Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl4Q9D8E6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms