Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc7Q9D541 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc7Q9D541 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc7Q9D541 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc7Q9D541 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc7Q9D541 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc7Q9D541 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc7Q9D541 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc7Q9D541 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms