Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc83Q9D4V3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms