Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 319.8 ms