Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bcas2Q9D287 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms