Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms