Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms