Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms