Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Higd2aQ9CQJ1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms