Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2a1Q99PM3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2a1Q99PM3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms