Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl1Q99N96 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl1Q99N96 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms