Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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