Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms