Protein–RNA interactions for Protein: Q925U4

Edem1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem1Q925U4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Edem1Q925U4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms