Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrif1Q923B3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms