Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atl3Q91YH5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms