Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csde1Q91W50 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms