Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stx18Q8VDS8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms