Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf8Q8VC56 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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