Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms