Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms