Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf183Q8QZS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf183Q8QZS5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf183Q8QZS5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rnf183Q8QZS5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf183Q8QZS5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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